Eine externe Firma hat 2021 die Lohnunterschiede zwischen Männern und Frauen an den UPK Basel untersucht. Sie kommt zum Schluss, dass die UPK Basel innerhalb des gesetzlichen Rahmens geschlechtergerechte Löhne bezahlt.
Die gesetzlich vorgeschriebene Lohngleichheitsanalyse wurde nach dem Standard-Analysemodell des Bundes durchgeführt und von einer unabhängigen Treuhandfirma überprüft. Diese bestätigt mit einem Zertifikat, dass die interne Lohngleichheit zwischen Männern und Frauen eingehalten wird.